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心理所合作研究构建首个创伤后应激障碍遗传学数据库PTSDgene
作者: 中国科学院心理健康重点实验室 ║ 日期: 2017/11/24 

  创伤后应激障碍(Posttraumatic stress disorder,PTSD)发生在创伤事件暴露之后,是一种具有复杂病因的综合征。美国2013年公布的第五版《精神障碍诊断与统计手册》(简称DSM-5)中,PTSD已经从“焦虑障碍”组移到新的分组“创伤和应激相关障碍”中。经历创伤事件是罹患PTSD的一个必要条件,一项关于全球创伤事件暴露的流行病学研究表明,70%的受访者至少报告了一例创伤事件,但其中只有少数人发展成为PTSD。研究表明,该病受遗传和环境因素的共同影响,但PTSD的病因和发病机制尚不清楚。迄今已有大量的PTSD分子遗传学研究发表,但是创伤性事件类别、性别、人种、创伤性事件发生时间和诊断时间的间隔、诊断方法和环境变量如何定义等因素都导致PTSD现有遗传学研究之间的高异质性,及现有结果的不一致性。目前已报道的PTSD易感位点和其他精神疾病相比非常有限,结果重复率低。这些问题对于研究者而言,将随着PTSD遗传学研究数量的增加而凸显,整合并分析已有PTSD遗传数据尤为必要。

  中国科学院心理健康重点实验室王晶研究组、张建新研究组与荷兰阿姆斯特丹大学Miranda Olff教授合作,基于对生物信息学技术和PTSD表型研究的积累,他们对PubMed、PsychINFO 和 PsychArticles三个数据库的1762篇文献初步筛选,最终选取105篇文献进行信息挖掘与整合。研究人员根据这些文献数据,首先对每一个变异位点和基因进行基本的功能注释;其次,根据已报道的显著易感基因进一步绘制蛋白-蛋白相互作用图(PPI);最后,研究者分别对现有研究的宏观层面(诊断方法、评定量表、研究设计方法、样本量和创伤性事件类型等)和微观层面(已报道的多证据支持的变异位点及其候选基因结果显著性、候选基因参与的生物学通路、遗传和环境交互作用、表观遗传研究等)的多种研究证据进行整合,呈现PTSD现有的遗传学研究现状。上述所有的研究、数据和整合分析结果都存放在网页版数据库PTSDgene(http://ptsdgene.psych.ac.cn/)中,供研究者自由地查询使用。

  PTSDgene是目前国际上首个关于PTSD的遗传学数据库,该数据库较为全面地基于文献数据展示了PTSD的遗传学研究现状,为后续研究提供广泛而可靠的数据集。另一方面,通过深入挖掘与分析数据得到PTSD潜在的候选位点,为验证研究提供可靠候选,也为理解相关遗传因子的作用通路提供理论基础,以期最终揭示PTSD的遗传基础和发病机制。

  该研究受国家科技支撑计划项目(2013BAI08B02)和国家自然科学基金项目(31271099,31471004,31401139)资助,相关文章目前已在线发表于Neuroscience & Biobehavioral Reviews(5-Year-IF=10.156)杂志。

  论文信息:

  Zhang, K.#, Qu, S.#, Chang, S.#, Li, G., Cao, C., Fang, K., Olff, M., Wang, L.*, Wang, J*. (2017). An overview of posttraumatic stress disorder genetic studies by analyzing and integrating genetic data into genetic database PTSDgene. Neurosci Biobehav Rev. doi:10.1016/j.neubiorev.2017.08.021

  全文链接:

  http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0149763416307333

 

 

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